Для переноса ЭП необходимо выгрузить ветку реестра HKLM\SOFTWARE\CryptoPro\Settings\Users\{SID}\Keys\ 

В x64 ОС контейнеры лежат в

HKLM\SOFTWARE\Wow6432Node\CryptoPro\Settings\Users\{SID}\Keys\

На том рабочем месте куда необходимо импортировать смотрим разрядность ОС\SID пользователя, блокнотом правим полученный .reg файл(менять SID и, если необходимо, путь к конечной ветке), и импортируем его в реестр.